Na Institutu se trenutno provodi samo jedan bilateralni projekt koji se financira sredstvima državnog proračuna putem natječaja provedenog od strane Ministarstva znanosti, obrazovanja i mladih, a na temelju ugovora o znanstvenoj i istraživačkoj suradnji između Republike Hrvatske i drugih država. 

Hrvatsko-mađarska suradnja 

• Naziv projekta: „Crkvena i svjetovna elita između 15. i 19. stoljeća“ // suradna institucija Institut za povijest Centra za humanističke studije u Budimpešti // voditeljica projekta dr. sc. Marija Karbić 

Institutu je dosad uspješno provedeno više projekata koje koji su financirani na sličan način iz državnog proračuna . Više o tome saznajte na poveznici Okončani projekti.